생물정보학/Useful PAGEs

Bedtools: 같은 아이디로 모든 feature를 합칠 때

케이든 2016. 1. 12. 11:21

 

https://www.biostars.org/p/145751/

 

sort -k4,4 result.bed | groupBy -g 1,4 -c 4,2,3 -o count,min,max | awk -v OFS='\t' '{print $1, $4, $5, $2, $3}' > result.bed

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