Khydyn's Plant Pathology Blog

트리 만들기 가계도와 같이 계통수도 조상에 대한 패턴을 나타냅니다. 가계도는 가족들이 종이에 적어서 가족의 역사를 보여줄 수는 있지만, 자연에서의 종(species)은 자신의 가계도를 기록하지 않습니다. 그러므로 생물학자들이 대신해서 증거들을 모으고 분석하여 계통의 역사를 쓰고 ..

사다리 구조가 아니라 트리 구조 (Trees, not ladders) 과거에 여러번 생물학자들은 생물을 하등 동물에서 고등 동물로 사다리 처럼 구성할 수 있을 것이라고 생각하는 실수를 범 했었습니다. 이런 생각은 아리스토텔레스의 존재의 대사슬(Aristotle's Great Chain of Being)에서 볼 수 있습니다. 이와 ..

BEAST 용어해설 (NOTE: 번역이 깔끔하지 못함) 베이지언 (Bayesian)베이지언 추론은 통계적 추론의 한 방법으로, 추론해야 하는 대상의 사전 확률과 추가적인 관측을 통해 해당 대상의 사후 확률을 추론하는 방법이다. 베이지언 추론은 베이지언 확률론을 기반으로 하며, 이는 추론하는 대상을 ..

곰팡이의 타임트리 (The Timetree of Fungi) 진균계(곰팡이들)의 멤버들은 전지구적인 영양소 순환과 다른 생물들과의 공생에서 매우 중요한 역할을 합니다. 이들은 균근으로서 식물과 아주 밀접한 관계를 맺고 있습니다. 그리고 lignin의 주요 분해자 입니다. 곰팡이들은 후생동물아계(Metazoa)의 ..

계통발생 이해하기 2 분기군(clade)은 공통 조상(common ancestor)과 모든 후손들(현존 + 멸종)을 포함하는 구룹입니다. 계통발생을 사용하여, 계통들의 그룹이 하나의 분기군을 형성하나 볼 수 있습니다. 나무에서 하나의 가지를 친다고 생각해 보세요! 하나의 가지에서 분리된 가지(생물)들은 ..

계통발생 이해하기 1 계통발생을 이해하는 것은 마치 가계도를 읽는 것과 똑같습니다. Tree의 뿌리(root)는 조상 계통을 나타냅니다. 그리고 가지들의 끝은 그 조상의 후손들을 나타냅니다. 뿌리에서 가지 끝으로 갈 수록 시간은 앞으로 갑니다. 하나의 계통이 갈라질 때(종 분화, speciation)는..

The Family Tree (계통수) 진화 과정은 종들 사이의 관계에서 패턴을 만들어 냅니다. 계통들은 진화하고 분기되고, 변형은 유전 됩니다. 그로인해 계통들의 진화적 경로 갈라지게 됩니다. 이로 인해 진화적 관계의 (나무)가지 패턴이 생성됩니다. 유전되는 종들의 특징들과 다른 역사적 증거들..

생명의 역사: 패턴 들여다 보기 진화의 중심 생각은 생명이 역사를 갖고 있다는 것 입니다. 생명은 시간에 따라 변화하였고, 각기 다른 종들은 공통 조상을 공유하고 있습니다. 여기서는 진화적인 변화와 진화적인 관계가 "family trees"들로 어떻게 표현 되는지 탐험 할 수 있습니다. 그리고 ..

The Newick Tree Format 이 글은 http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/newicktree.html 에서 발췌 번역한 것 입니다. 소 개 컴퓨터가 읽을 수 있는 trees를 대표하는 형식인 Newick Standard는 1857년 영국의 유명한 수학자 Arthur Cayley가 고안하였고, trees에 나오는 인자들과 중접된 괄호를 사용합니다. 만약에 ..

진화에 대한 소개 정 의: 생물학적 진화는 간단히 말하자면 변형과 함께 유래되는 것 입니다. 이 정의는 소규모 진화와 대규모 진화를 포함합니다. 소규모 진화: 집단(population)이 한 세대에서 다음 세대로 갈 때 유전자 빈도(gene frequency)의 변화 대규모 진화: 하나의 공통 조상(common ancestor)..