Polyadenlyation

 

Polyadenylation

 

전사물의 cleavage와 polyadenylation은 cis-acting RNA elements와 수십개의 주요 및 부수적인 polypeptide를 필요로 한다. Trans-acting factor들과 이에 상응하는 cis-elements들을 비슷하게 색칠하였다. cleavage를 결정하는 주요 cis-element는 6nt motif의 poly(A) tail signal (PAS)이고 표준 형태는 AAUAAA이지만 +10개 이상의 변종이 있으며 cleavage site에서 15-30nt 위쪽에 위치한다. PAS에 더하여, U 또는 GU 가 풍부한 downstream elements (DSE)가 가까이 있으며, upstream sequence elements (USE)가 cleavage의 효율을 촉진시킨다. Cleavage and polyadenylation specific factor (CPSF)와 clevage stimulating factor (CSTF)는 2개의 multi-polypeptide 복합체로 각각 PAS와 DSE를 인지하여 이 두 elements 사이의 cleavage를 촉진시킨다. CPSF는 CPSF4, CPSF2, CPSF1, CPSF3, FIP1L1, WDR33 6개의 polypeptide들로 이루어져 있으며, 그 중 CPSF1이 PAS를 인지한다. CSTF는 CSTF1, 2, 3로 이루어져 있는데 이는 PAS 결정에 영향을 준다. Cleavage와 polyadenaltion에 필요한 추가적인 요소들은 진화적으로 잘 보존된 poly(A) polymerase (PAP), 구조단백질 simplekin 그리고 cleavage factor Im (CFIm)과 CFIIm이 있다. CFIm은 CPSF6와 CFIm25 두 개의 subunit으로 구성된 tetramer이고 USE의 UGUA motif와 더 큰 2개의 polypeptide들과 결합한다. PAB는 poly(A) binding protein이다.