생물정보학/Genomics

GTF/GFF2 to GFF3

케이든 2016. 6. 8. 15:19


Cufflinks는 gtf output을 gff로 변환해주는 tool 인 gffread가 있습니다.


gffread -E merged.gtf -o- > merged.gff3


이것은 에러(-E)와 standard out(-o-)을 해 줍니다.


출처: https://www.biostars.org/p/50445/


그 외 유용한 perl 파일 올림


gtf2gff3.pl





gtf2gff3.pl
0.04MB