Cufflinks는 gtf output을 gff로 변환해주는 tool 인 gffread가 있습니다.
gffread -E merged.gtf -o- > merged.gff3
이것은 에러(-E)와 standard out(-o-)을 해 줍니다.
출처: https://www.biostars.org/p/50445/
그 외 유용한 perl 파일 올림
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