Khydyn's Plant Pathology Blog

리눅스에서 사용되는 vi 에디터의 글자색을 바꿔보자 /etc/vimrc 파일에는 모든 사용자에게 지정되는 vi 설정이 들어있고 이파일을 사용자 루트디렉토리에 .vimrc로 복사하고 원하는 설정으로 바꾸어 주면 된다 ! :hi 를 치면 설정된 색들이 나오고 이중에 맘에 안드는 놈들 골라서 변경해 주면..

리눅스의 기본 디렉토리 구조는 트리 구조를 하고 있다. 그리고 디렉토리 구조는 기본구조를 제외하고 사용자의 설정에 따라 달라질 수 있다. 리눅스의 디렉토리 구조는 파일 시스템 표준안 (FSSTND, Linux File System Standard)을 기반으로 하는 것이 바람직하다. 파일 시스템 표준안은 리눅스상..

chmod명령어는 특정파일 또는 디렉토리의 퍼미션(permission)을 설정하는 명령어이다. 퍼미션이란, 특정파일이나 디렉토리에 대하여 읽기, 기록하기, 삭제하기 등의 권한을 설정해놓은 것으로 다중사용자 운영체제에서 파일의 접근권한과 보호등을 위하여 반드시 필요한것이다. >> 파일..

리눅스 환경변수 설정하기 파일을 설치한다음 파일을 어디에서나 실행 가능하게 하기 위해서는 환경변수를 설정해주어야 합니다. > export 명령어를 입력하면 모든 환경변수를 볼 수 있습니다. 그리고 환경변수를 설정하려면 > vi /etc/bashrc 로 들어가 제일 및에 export PATH=$PATH: 에서 " : "..

Blast를 하기 위해서는 query와 database가 있어야 합니다. 그러므로 어떤 유전체에 대한 all-vs-all blast를 하려면 일단 그 유전체를 사용해 database를 만들고 다시 그 유전체를 query로 사용하여 blast를 수행하면 됩니다. Database를 만드는 방법: >makeblastdb -in input_database(query)_file.fasta -dbtype prot -out my..